低温等离子灭菌器和环氧乙烷灭菌器的区别主要有以下几个方面：

- 灭菌原理：低温等离子灭菌器是利用过氧化氢溶液和高频电场产生的等离子体对微生物进行杀灭，而环氧乙烷灭菌器是利用真空低温环境下的环氧乙烷气体对微生物进行烷基化作用，抑制其新陈代谢

- 灭菌时间：低温等离子灭菌器的灭菌时间大约在25-55分钟，而环氧乙烷灭菌器的灭菌时间大约在6-8小时。这对于医院来说，时间短的低温等离子灭菌器更有优势，但是对于一次性医用口罩、防护服等物品来说，环氧乙烷灭菌器的灭菌效果更彻底。

- 穿透性：环氧乙烷有着非常好的穿透性，可以对各种材料和结构的物品进行灭菌，除了油、粉剂和液体之外。而过氧化氢的穿透性不是很好，不能对纸、布、液体、亚麻等物品进行灭菌。因此，在选择灭菌方法时要考虑物品的特性和包装材料。

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