每条内镜使用后均需要经过严格的清洗消毒流程，按照国家卫生行业标准WS507-2016的要求，具体包括床旁预处理，测漏，酶洗，漂洗，浸泡消毒，终末漂洗，酒精干燥，保证每条内镜在使用前都是符合感控要求的。

床边用含酶湿纱布擦洗镜身外表面，反复送气、送水至少10秒，抽吸清洗液直至流入吸引管。

在酶洗槽内配置清洗液，反复擦洗镜身，重点擦拭插入部和操作部，擦拭布一用一更换。刷洗内镜所有管道，两头见刷头，并洗净刷头上的污物，反复刷洗至无可见污染物。用浓度为1：300的酶洗液灌流2分钟，冲洗各管道及镜身，酶洗液一用一更换。

用流动水灌流冲洗各管道，直至无清洗液残留，用流动水冲洗内镜外表面、按钮和阀门。用气枪向各管道充气至少30秒，用擦拭布擦干内镜外表面的水分

将内镜连同管道灌流器以及按钮、阀门移入消毒槽内并完全浸没于浓度为1:10的消毒液中，10分钟消毒后，更换手套，向各管道至少充气30秒，去除管道内的消毒液

将内镜连同管道灌流器以及按钮、阀门移入终末漂洗槽内，用纯化水冲洗内镜各管道及镜身至少2分钟，直至无消毒液残留。

将内镜、按钮和阀门置于铺设无菌巾的专用干燥台上，用75%的酒精灌注所有管道。使用压力气枪向各管道内充气至少30秒至其完全干燥。用无菌布擦拭内镜外表面、按钮和阀门。